داستان بازی در سال ۲۱۸۳ کمی بعد از اتفاقات نسخه اول مس افکت رخ می دهد. در آخرین لحظات نسخه اول دیدیم که کاپیتان Shepard که کنترل سفینه نورماندی را بر عهده دارد، با یک حمله ناگهانی از سوی بیگانگان روبرو می شود، سفینه او در اثر این حمله به شدت آسیب می بیند. او که متوجه می شود سفینه اش در حال نابودی است، سعی می کند تمام افراد را از آن جا خارج کند، اما زمانی که خودش قصد خروج از سفینه را دارد، مورد حمله بیگانه ها قرار می گیرد و می میرد. جسد او در فضا رها می شود و داخل یک Shadow Broker می شود و پس از مدتی توسط زنی به نام Liara T’Soni که یک انسان تکامل یافته است، پیدا می شود. او که سعی دارد شپارد را دوباره زنده کند، بدن او را وارد پروژه ای به نام Lazarus می کند. پس از ۲ سال شپارد به هوش می آید و …
این بازی دارای بهترین و جالبترین گرافیک ها میباشد، محیط بازی کاملاً با جوی فضایی و وهم انگیز همراه است در محیط به جزییات بیشترین دقت ممکن شده است که زیبایی زیادی به بازی بخشیده است.
طراحی چهره ها و اندام بسیار زیبا هستند چهره ها با حس های مختلف ساخته شده اند که شباهت زیادی به واقعیت دارد حرکت لب ها بسیار زیبا هستند که کاملاً با دیالوگ ها هماهنگ است. نورپردازی ها بسیار ظریف و انعطاف پذیر هستند و کوچکترین اشیا در بازی سایه ای هماهنگ و همانند با خود دارند. شعاع های نور و زیاد و یا کم بودن نور بسیار جالب و شگفت انگیز طراحی شده است که جلوه ای بسیار زیبا به بازی داده است. بافت ها بهترین کیفیت ممکن را دارند که خیلی عالیه هستند. طراحی دشمنان هم بسیار زیباست و بسیار متنوع ساخته شده اند، بازی ترکیبی از سبک نقش آفرینی و اکشن سوم شخص است. در طول بازی با اشخاص مختلفی صحبت می کنید. در این گفتگوها باید به سوال های مختلفی جواب بدهید. البته جواب ها به صورت چند گزینه ای است که با توجه به جریان بازی باید بهترین جواب را انتخاب کنید. روند بازی تقریبا تغییر پذیر است و با توجه به عملکرد شما تغییراتی در داستان بازی ایجاد می شود. همان طور که گفته شد این عنوان یک بازی اکشن نقش آفرینی است. در بازی می توانید قابلیت های مختلف شخصیت اصلی و هم تیمی هایتان را افزایش دهید. البته این روند هم می تواند خودکار باشد و هم می تواند به صورت دستی صورت بگیرد. در طول بازی توانایی استفاده از سلاح ها و قدرت های مخصوصی را به دست می آورید که می توانید آن ها را تقویت کنید و از آن ها در طول بازی بهترین استفاده را ببرید. قسمت های اکشن بازی هم بسیار نفس گیر و زیبا طراحی شده اند. همانند سایر بازی های سوم شخص می توانید پشت مکان های مختلف پناه بگیرید، به همراهی هم تیمی هایتان بازی را به طرق مختلف پیش ببرید و به آن ها دستور بدهید که به کدام سو بروند و یا به کدام دشمن حمله کنند، البته باید به این نکته هم اشاره کرد که یاران شما هر کدام قدرت های مختلفی دارند که باید از آن ها به درستی استفاده کنید. در بازی صحنه های سینمایی و جذاب بسیار زیادی وجود دارند که هر کدام از آن ها به زیبایی کارگردانی و طراحی شده اند.